侵华战争时期，日本人将掠得的北京猿人头骨偷运回国，途中沉没，成为一桩疑案。当年日本人将头骨化石偷运回国，隐藏几十年后，在和平环境下重新进行研究。他们将头骨化石中的DNA残片提取出来，进行培育，然后

The film opens with a narrated disclaimer over footage of an opening coffin. The narrator explains

19年后，印第安纳琼斯博士（HarrisonFord饰）再次启程，旨在将埃克托王国遗失的水晶骷髅头骨归还原地——传说中，归还圣物者将被赐予巨大力量。在琼斯的老友奥克斯发现水晶头骨前，这一切还只是传说。